Генетическая вариабельность риккетсий в клещах Dermacentor spp. на территории Западной Сибири и Северного Казахстан

Генетическая вариабельность риккетсий в клещах Dermacentor spp. на территории Западной Сибири и Северного Казахстан Научная публикация

Журнал

Молекулярная генетика, микробиология и вирусология
ISSN: 0208-0613

Вых. Данные

Год: 2023, Том: 41, Номер: 3, Страницы: 25‑34 Страниц : DOI: 10.17116/molgen20234103125

Ключевые слова

КЛЕЩИ DERMACENTOR SPP, РИККЕТСИОЗЫ, RICKETTSIA SIBIRICA, RICKETTSIA AESCHLIMANNII, «CANDIDATUS RICKETTSIA TARASEVICHIAE», GLTA, OMPA, OMPB, ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ

Авторы

Якубовский В.И. ¹ , Иголкина Я.П. ¹ , Тикунов А.Ю. ¹ , Панов В.В. ² , Якименко В.В. ³ , Жабыкпаева А.Г. ⁴ , Епихина Т.И. ¹ , Рар В.А. ¹

Организации

1	ФГБУН Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН, Новосибирск, Россия
2	ФГБУН Институт систематики и экологии животных СО РАН, Новосибирск, Россия
3	ФБУН Омский научно-исследовательский институт природно-очаговых инфекций, Омск, Россия
4	НАО «Костанаский региональный университет им А. Байтурсынова», Костанай, Республика Казахстан

Информация о финансировании (1)

МИНИСТЕРСТВО НАУКИ И ВЫСШЕГО ОБРАЗОВАНИЯ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ

ПФНИ РФ (2021-2030) 0245-2021-0008

Цель исследования. Изучить распространение, видовое разнообразие и генетическую вариабельность риккетсий в клещах Dermacentor spp. на территории Западной Сибири и Северного Казахстана. Материал и методы. Образцы от 571 клеща рода Dermacentor (406 Dermacentor reticulatus, 136 Dermacentor nuttalli, 21 Dermacentor marginatus и 8 Dermacentor silvarum) были исследованы на наличие ДНК Rickettsia spp. методом двухраундовой ПЦР. Видовая принадлежность риккетсий была установлена методом видоспецифичной ПЦР и/или секвенированием фрагментов gltA гена. Для ряда образцов Rickettsia raoultii были дополнительно определены нуклеотидные последовательности фрагментов генов ompA (3266 н.п.) и ompB (4852 н.п.). Результаты. В исследованных клещах обнаружена ДНК четырех видов риккетсий, а также нового генотипа Rickettsia spp. Ko-97-Dr, не относящегося к известным видам. Все виды клещей наиболее часто были инфицированы R. raoultii; уровень инфицированности варьировал от 47,0 до 86,8%. ДНК Rickettsia sibirica была обнаружена в 16,1-45,7% D. nuttalli на трех участках Республики Алтай. ДНК Rickettsia aeschlimannii, Rickettsia aeschlimannii-like, «Candidatus Rickettsia tarasevichiae» и новый генотип Rickettsia sp. Ko-97-Dr были обнаружены в единичных D. reticulatus и D. marginatus. На основании анализа фрагмента гена gltA было идентифицировано семь сиквенс-вариантов R. raoultii, четыре из которых соответствовали ранее описанным генотипам данного вида. Проведенный анализ образцов R. raoultii по протяженным фрагментам ompA и ompB показал наличие трех генетических групп, соответствующих различным генотипам по гену gltA. Заключение. В клещах Dermacentor spp. были обнаружены как типичные, так и нетипичные для данных клещей виды риккетсий. Показано существование природных очагов сибирского клещевого тифа на территории Республики Алтай. На основании анализа вариабельных генов поверхностных белков и консервативного гена gltA показано существование трех генетических групп R. raoultii.

Якубовский В.И. , Иголкина Я.П. , Тикунов А.Ю. , Панов В.В. , Якименко В.В. , Жабыкпаева А.Г. , Епихина Т.И. , Рар В.А.
Генетическая вариабельность риккетсий в клещах Dermacentor spp. на территории Западной Сибири и Северного Казахстан
Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. 2023. Т.41. №3. С.25‑34. DOI: 10.17116/molgen20234103125 РИНЦ OpenAlex

Yakubovskij V.I. , Igolkina Y.P. , Tikunov A.Y. , Panov V.V. , Yakymenko V.V. , Zhabykpayeva A.G. , Epikhina T.I. , Rar V.A.
Genetic Diversity of Rickettsiae in Dermacentor spp. Ticks on the Territory of Western Siberia and Northern Kazakhstan
Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. 2023. V.38. N3. P.158-167. DOI: 10.3103/s0891416823030102 Scopus OpenAlex

РИНЦ:	54522126
OpenAlex:	W4387067957

Пока нет цитирований