Abstract: Созданы новые двухкомпонентные флуоресцентные зонды для детекции микроРНК на основе олиго(2'-O-метилрибонуклеотидов), формирующие в присутствии РНК-мишени 3WJ-структуру из трех олигонуклеотидных дуплексов (3WJ – three-way junction) со вставкой PyA-модифицированного аденинового кластера, представляющего собой пентааденозиновый фрагмент, содержащий в центре 8-(1-этинилпирен)-дезоксирибоаденозин. В качестве РНК-мишени выбрана микроРНК let-7a-3p, уровень которой в клетке коррелирует с возникновением и развитием онкологических заболеваний. Проведено сравнительное исследование термической стабильности и флуоресценции двухкомпонентных зондов на основе олиго(2'-O-метилрибонуклеотидов), в составе которых имеется дезоксирибоаденозиновый (dAdAPyAdAdA) или (2'-O-метилрибо)аденозиновый фрагмент (AmAm PyAAmAm), содержащий в центре 8-(1-этинилпирен)-дезоксирибоаденозин, и аналогичного олигодезоксирибонуклеотидного зонда. Обнаруженное изменение спектров флуоресценции созданных зондов при гибридизации с РНК-мишенью потенциально может быть использовано при разработке систем детекции микроРНК.

Cite: Семиколенова О.А. , Голышев В.М. , Ким Б-Х. , Веньяминова А.Г. , Новопашина Д.С.
Новые двухкомпонентные пиренильные зонды на основе олиго(2'-О-метилрибонуклеотидов) для детекции микроРНК
Биоорганическая химия. 2021. Т.47. №2. С.218-227. DOI: 10.31857/S0132342321020238 РИНЦ OpenAlex

Translated: Semikolenova O.A. , Golyshev V.M. , Kim B.H. , Venyaminova A.G. , Novopashina D.S.
New Two-Component Pyrene Probes Based on Oligo(2'-O-Methylribonucleotides) for microRNA Detection
Russian Journal of Bioorganic Chemistry. 2021. V.47. N2. P.432-440. DOI: 10.1134/S1068162021020230 WOS Scopus OpenAlex

Dates:

Submitted:

Sep 14, 2020

Identifiers:

Elibrary:	44768843
OpenAlex:	W3134474188

Citing: Пока нет цитирований

Altmetrics: