Оценка конкордантности мутационного статуса опухолевого материала и циркулирующей в крови опухолевой ДНК при колоректальном раке

Оценка конкордантности мутационного статуса опухолевого материала и циркулирующей в крови опухолевой ДНК при колоректальном раке Full article

Journal

Тазовая хирургия и онкология

Output data

Year: 2022, Volume: 12, Pages: 27-34 Pages count : 8 DOI: 10.17650/2686-9594-2022-12-1-27-34

Authors

Полянская Е.М. ¹ , Федянин М.Ю. ^1,2,3 , Боярских У.А. ⁴ , Кечин А.А. ⁴ , Мороз Е.А. ¹ , Поляков А.Н. ¹ , Kудашкин Н.Е. ¹ , Подлужный Д.В. ¹ , Храпов Е.А. ⁴ , Оскорбин И.П. ⁴ , Шамовская Д.В. ⁴ , Алиев В.А. ¹ , Мамедли З.З. ¹ , Трякин А.А ¹ , Филипенко М.Л. ⁴ , Тюляндин С.А. ¹

Affiliations

1	ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр онкологии им. Н.Н. Блохина» Минздрава России
2	ГБУЗ «Московский многопрофильный клинический центр «Коммунарка» Департамента здравоохранения г. Москвы»
3	ФГБУ «Национальный медико-хирургический центр им. Н.И. Пирогова»
4	Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН

Введение. для улучшения результатов лечения пациентов с колоректальным раком (кРР) необходимо изучение маркеров прогрессирования после радикального лечения и в процессе химиотерапии. В данном контексте представляет интерес изучение циркулирующей в крови опухолевой дНк (цодНк).Цель исследования - оценить чувствительность разработанной тест-системы по выявлению цодНк и конкордантность выявленных изменений генетическим альтерациям в первичной опухоли у больных кРР.Материалы и методы. В исследование включались пациенты с морфологически верифицированным кРР I-Iv стадии, проходившие лечение в Фгбу «Национальный медицинский исследовательский центр онкологии им. Н.Н. блохина» минздрава России в период с 2016 по 2021 г. Выделение дНк из блока первичной опухоли осуществлялось при помощи набора QIAamp DnA ffPE Tissue Kit (Qiagen, германия). Перечень мутаций опухоли был определен при помощи полногеномного секвенирования (ngS). с целью обогащения ngS-библиотеки применялась мультиплексная полимеразная цепная реакция. для секвенирования библиотек использовалась платформа miniSeq (Illumina). Определение опухольспецифичных соматических мутаций в цодНк из образцов плазмы крови проводилось с помощью ddPCR (цифровая капельная полимеразная цепная реакция).Результаты. Чувствительность тест-системы по выявлению генетических нарушений в опухолевом материале составила 97,82 %, в цодНк - 51,20 % для всех стадий заболевания и 64,5 % для метастатического кРР. конкордантность между первичной опухолью и цодНк для всех стадий составила 69,4 % (95 % доверительный интервал (дИ) 62,2-76,0): для I-III стадий - 65,4 % (95 % дИ 57,1-73,1), при отдаленных метастазах - 83,8 % (95 % дИ 69,6-92,9). конкордантность по гену KRAS для всех стадий - 78,3 % (95 % дИ 66,7-87,3), для Iv стадии - 90,9 % (95 % дИ 64,7-99,0). конкордантность по гену BRAF составила 70 % (95 % дИ 39,4-90,7), для Iv стадии - 75,0 % (95 % дИ 28,4-97,2). показатель совпадений возрастал для всех генов по мере увеличения критерия T, был наибольшим для категории nx.Выводы. В работе показана высокая чувствительность тест-системы по выявлению генетических альтераций в опухолевом материале и плазме крови. конкордантность цодНк и тканей первичной опухоли также оказалась удовлетворительной, особенно в отношении статуса генов KRAS и BRAF при метастатическом заболевании, что позволяет рассматривать ее в качестве альтернативы классическому определению мутаций в генах в опухолевом материале.

Полянская Е.М. , Федянин М.Ю. , Боярских У.А. , Кечин А.А. , Мороз Е.А. , Поляков А.Н. , Kудашкин Н.Е. , Подлужный Д.В. , Храпов Е.А. , Оскорбин И.П. , Шамовская Д.В. , Алиев В.А. , Мамедли З.З. , Трякин А.А. , Филипенко М.Л. , Тюляндин С.А.
Оценка конкордантности мутационного статуса опухолевого материала и циркулирующей в крови опухолевой ДНК при колоректальном раке
Тазовая хирургия и онкология. 2022. Т.12. С.27-34. DOI: 10.17650/2686-9594-2022-12-1-27-34 РИНЦ OpenAlex

Elibrary:	48241413
OpenAlex:	W4223944779

DB	Citing
Elibrary	1
OpenAlex	1