Identification of Chimeric NTRK3 Genes in Papillary Thyroid Cancer Cells by Analyzing the Imbalance of the Expression of 5’ and 3’ mRNA Fragments Научная публикация
Журнал |
Bulletin of Experimental Biology and Medicine
ISSN: 0007-4888 |
||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Вых. Данные | Год: 2023, Том: 175, Номер: 2, Страницы: 239–244 Страниц : DOI: 10.1007/s10517-023-05842-x | ||||||||
Ключевые слова | TRK; NTRK3; papillary thyroid cancer; chimeric mRNA; RT-PCR | ||||||||
Авторы |
|
||||||||
Организации |
|
Реферат:
The standard for detecting chimeric genes of neurotrophic receptor tyrosine kinases (NTRK) is next generation sequencing (NGS). However, this analysis is expensive and takes several days. As a rapid screening method for the detection of NTRK3-dependent papillary thyroid cancer, an analysis of the expression imbalance between 5’ and 3’ NTRK3 mRNA fragments was used (5’/3’ RT-PCR). The reference method for detection of NTRK3 rearrangements was fluorescent in situ hybridization (FISH), and the most frequent rearrangements in papillary thyroid cancer were tested using reverse transcription PCR (RT-PCR). Using 5’/3’ RT-PCR, 18 samples of papillary thyroid cancer carrying chimeric transcripts of NTRK3 mRNA were detected. The sensitivity of the developed technique was 88.9% and specificity was 99.3%. Thus, a fast and cost-effective method of screening samples of papillary thyroid cancer in paraffin blocks is proposed with acceptable sensitivity and specificity.
Библиографическая ссылка:
Oskorbin I.P.
, Ivanov A.A.
, Smertina M.A.
, Demidova3 A.
, Boyarskikh U.A.
, Kechin A.A.
, . Bakharev S.Y.
, Samuilenkova O.V.
, Vihlyanov I.V.
, Kushlinskii N.E.
, Filipenko M.L.
Identification of Chimeric NTRK3 Genes in Papillary Thyroid Cancer Cells by Analyzing the Imbalance of the Expression of 5’ and 3’ mRNA Fragments
Bulletin of Experimental Biology and Medicine. 2023. Т.175. №2. С.239–244. DOI: 10.1007/s10517-023-05842-x WOS Scopus
Identification of Chimeric NTRK3 Genes in Papillary Thyroid Cancer Cells by Analyzing the Imbalance of the Expression of 5’ and 3’ mRNA Fragments
Bulletin of Experimental Biology and Medicine. 2023. Т.175. №2. С.239–244. DOI: 10.1007/s10517-023-05842-x WOS Scopus
Оригинальная:
Оскорбин И.П.
, Иванов А.А.
, Смертина М.А.
, Демидова И.А.
, Боярских У.А.
, Кечин А.А.
, Бахарев С.Ю.
, Самуйленкова О.В.
, Вихлянов И.В.
, Кушлинский Н.Е.
, Филипенко М.Л.
Выявление химерных генов NTRK3 в клетках папиллярного рака щитовидной железы с помощью анализа дисбаланса экспрессии 5' и 3' фрагментов мРНК
БЮЛЛЕТЕНЬ ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНОЙ БИОЛОГИИ И МЕДИЦИНЫ. 2023. Т.175. №2. С.203-209. DOI: 10.47056/0365-9615-2023-175-2-203-209 РИНЦ
Выявление химерных генов NTRK3 в клетках папиллярного рака щитовидной железы с помощью анализа дисбаланса экспрессии 5' и 3' фрагментов мРНК
БЮЛЛЕТЕНЬ ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНОЙ БИОЛОГИИ И МЕДИЦИНЫ. 2023. Т.175. №2. С.203-209. DOI: 10.47056/0365-9615-2023-175-2-203-209 РИНЦ
Даты:
Опубликована online: | 2 июн. 2023 г. |
Идентификаторы БД:
Web of science | WOS:001034249500001 |
Scopus | 2-s2.0-85165278259 |
OpenAlex | W4384925884 |
Цитирование в БД:
Пока нет цитирований